El sistema principal de Permapreta® reside en el funcionamiento de la cuba, de la cual disponemos de varios tamaños. A través del orificio principal, donde se coloca el inodoro caen los excrementos a las rejillas, allí les espera un lecho de microorganismos y lombrices rojas (Eisenia foetida). Estas son encargadas de procesar la materia fecal hasta convertirla en hummus que caerá en la parte cónica de la cuba.
Como podéis observar, en la cuba hay varios orificios aparte del orificio principal, dos agujeros, de tamaño más pequeño (100mm). Elegiremos uno de ellos (el otro de igual tamaño no se usará), este diseño facilita la colocación del tubo de extracción, por tanto, el agujero elegido se conectará con el sistema de extracción de aire híbrido. El otro agujero de un tamaño un poco superior al de ventilación (125mm), llega hasta debajo de las rejillas, este estará destinado a ser el lugar por donde introduciremos el sinfín o aspirador de extracción, para realizar el vaciado del humus ya procesado. De esta forma, no hay necesidad de desmontar el sistema ni paralizarlo. Este proceso de extracción se realizará a los dos años de haber sido instalado por primera vez y posteriormente una vez cada año.